今年で385年になる長崎くんちの歴史。昭和20年夏の長崎原爆投下の年ですら、市民たちの頑張りによりその秋に開催されたという逸話から、「長崎市民の心意気」と称えられることが多いのですが、実はこの祭は人民たちによって自発的に発生した祭ではなく、江戸時代初期の長崎奉行・長谷川権六と長崎代官・末次平蔵による諏訪神社の勧請と建設、続いて「諏訪祭礼」の執行のお触れでは、従わない者は極刑、領地からの追放と言う厳しい罰が下るとし、強制参加がマストの官製祭礼が起源なのです。なぜ、当時の長崎奉行は諏訪祭礼を行うことを強行したのでしょうか。

これには、豊臣時代から江戸幕府開府当時の歴史が関わっていました。長崎は1571年、海外との貿易港として開港します。これにより、ポルトガルやスペインなどのカトリックの大国から多くの宣教師が訪れ、その布教活動により、キリスト教徒が増えていきました。そして切支丹大名として知られる大村純忠による寄進によって長崎・茂木はイエズス会の領地へと瞬く間に変貌していたのです。
驚いた豊臣秀吉は、天正15（1587）年、吉利支丹伴天連追放令（きりしたんばてれんついほうれい）を発して、宣教師による布教活動や人身売買、肉食などの日本の風土に合わない慣習を禁じました。しかしこれは、長崎のキリスト教徒（切支丹）たちの信仰心を反抗心に変えました。実際このときから洗礼受洗者の数は急増していますし、切支丹たちによる長崎に古くから存在した神社や寺への放火・破壊などの過激な行動がエスカレートします。長崎領内の寺院、神宮寺、神社などがほぼ全滅になるという惨事で、僧侶や宮司たちは、襲われる恐怖で外出もできなかったと伝わります。

これを受けて、慶長17（1612）年とその翌年に江戸幕府は「慶長の禁教令」を発します。宣教師の追放にとどまらない、徹底的なキリスト教の信仰自体の禁止と教会の破壊が命ぜられたのでした。それでもかえって信仰を厚くし、日本在来の僧侶神官への反感を高める長崎切支丹に業を煮やし、長崎代官は佐賀の修験者（山伏）・青木賢清を招き、新たに総鎮守を建設することを依頼します。先鋭化・暴徒化しつつあった切支丹に対抗できるのは、腕っぷしの強い山伏しかいない、と思ったのかもしれません。切支丹から見れば、山伏はまさに「天狗」。有翼の悪魔の化身として見立てられ、青木賢清の事業は切支丹たちのさまざまな妨害にあいますが、寛永2（1625）年、諏訪三所大明神社が創建され、その9年後から例大祭、つまり長崎くんちがはじまることとなったのです。